История открывается сообщением о том, что на берегу озера было обнаружено обнаженное тело Лоры Палмер, «завернутое в полиэтилен». Расследование ведут агент Купер, шериф Труман и его помощники, которые поочередно опрашивают различных жителей Твин Пикс.
По мере развития сюжета зрителю постепенно открывается мрачная и ужасающая изнанка существования обитателей этого, казалось бы, спокойного и безмятежного городка.